Tujuan dari program beasiswa APS adalah untuk meningkatkan kualitas sumberdaya manusia di Indonesia pada bidang Tata Kelola Ekonomi, Manajemen Sektor Publik dan Pendidikan. Program beasiswa APS adalah bagian yang penting dari kerjasama pembangunan yang sedang berjalan antara Pemerintah Indonesia dan Australia. Semenjak terjadinya gempa bumi dan tsunami di Aceh dan Sumatera Utara, Pemerintah Australia terus meningkatkan komitmennya untuk mendukung pembangunan di Indonesia. Program Beasiswa APS akan membiayai calon penerima beasiswa Indonesia menuju jenjang pendidikan Pasca Sarjana di Australia melalui suatu proses seleksi bersama oleh Pemerintah Australia dan Pemerintah Indonesia sesuai dengan tujuan-tujuan kebijakan umum yang telah disepakati. Program APS diatur melalui kantor proyek APS di Jakarta dan kantor IDP di Canberra untuk menjamin efisiensi dan keobyektifan proses administrasi program tsb.

Mengenai Kemitraan Australia Indonesia untuk Rekonstruksi dan Pembangunan (AIPRD)

Pada tanggal 5 Januari 2005, Perdana Menteri Australia mengumumkan tersedianya satu miliar dolar Australia untuk mendukung upaya rekonstruksi dan pengembangan di Indonesia, baik di luar maupun di dalam wilayah yang berdampak akibat bencana tsunami. Bantuantersebut difokuskan pada program reformasi pemerintah Indonesia dengan penekanan pada bidang perekonomian dan pembangunan sosial. Bentuk inisiatif kerjasama antara pemerintah Australia dan Indonesia ini diatur oleh AusAID melalui Kemitraan Australia Indonesia untuk Rekonstruksi dan Pengembangan.

Pendaftaran APS tahun 2006 telah ditutup tanggal 7 Juli dan tidak akan ada lagi pendaftaran untuk program APS di tahun selanjutnya.